Auf Rügen beginnt die insgesamt 2.500 km lange Deutsche Alleenstraße, die durch Süd-Rügen und weiter über Stralsund und Rheinsberg bis nach Süddeutschland führt.
Es gibt große Wälder auf der Insel. Diese sind der „Schaabe-Wald“, die Stubnitz auf Jasmund, die Wälder der „Schmalen Heide“ zwischen Binz und Mikran und die Wälder bei Göhren und Baabe. Zu den bedeutensten Wäldern gehören der Forst Werder, der Pansevitzer und der Ralswieker Forst. Herrliche Rotbuchenwälder auf den Inselkernen wechseln mit Kiefernwäldern der Heidegebiete auf den Nehrungen.
Die Tierwelt ist hier sehr vielseitig, insbesondere die der Vögel. Mit ihren Bodden, Buchten, Flachwasserbereichen und Salzwiesen ist die Insel ein idealer Rastplatz für tausende von Wildgänsen, Wildenten, Schwänen und Grauen Kranichen. Während ihres Zuges in die Winterquartiere in Frankreich und Spanien bleiben sie oft mehrere Wochen auf Rügen. Kormorane leben und brüten in großen Kolonien auf den Inseln Tollow und Zudar. Auch mehrere Seeadler-Paare haben sich angesiedelt.